부가가치세 추가 부담 청구, 항소심에서 1심 판결 뒤집고 전부 승소 이끌어낸 사례
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요약
매도인이 뒤늦게 건물 가액을 상향 신고하며 발생한 추가 부가가치세를 매수인에게 청구한 사건입니다.
1심은 매도인 승소로 판단하였으나, 저희 법인이 항소심에서 계약서에 명시되지 않은 의무는 함부로 인정할 수 없다는 점과 매수인이 실제로는 매입세액공제를 받을 수 없었다는 점을 입증하여 1심 판결을 뒤집고 원고 청구를 전부 기각시켰습니다.
기초사실
의뢰인은 매수인 법인으로, 서울 강남구 소재 토지와 건물을 총 100억 원에 매수하는 계약을 체결하였습니다.
계약서에는 매매대금과 별도로 건물분 부가가치세 1,500만 원을 잔금 지급 시 함께 납부하기로 명시되어 있었고, 의뢰인은 계약 내용대로 매매대금과 부가가치세를 모두 지급하였습니다.
그런데 계약 체결로부터 1년 5개월이 지난 시점, 매도인이 세무서로부터 건물 가액을 낮게 신고하였다는 지적을 받고 가액을 상향하여 재신고하면서 추가 세금을 납부하였고, 이 추가 세금을 의뢰인이 부담해야 한다며 소송을 제기하였습니다.
사건의 특징
1심 법원은 매도인의 청구를 받아들여 의뢰인에게 추가 세금 상당액의 지급을 명하였습니다.
계약서에 건물 가액을 사후에 협의하여 변경할 수 있다는 특약이 있었던 점, 의뢰인이 사업자로서 추가로 낸 부가가치세도 매입세액공제로 돌려받을 수 있다는 점을 근거로, 추가 부가가치세까지 의뢰인이 부담하기로 하는 암묵적 합의가 있었다고 판단한 것입니다. 사건을 넘겨받은 저희 법인이 검토한 결과, 이 판결에는 계약서 해석에 관한 대법원의 확립된 기준이 충분히 반영되지 않았다는 점, 그리고 매입세액공제를 받을 수 있다는 전제 자체가 세법상 사실과 다르다는 점이라는 두 가지 빈틈이 있었습니다.
우리 법인의 조력 내용
1. 계약서에 명시되지 않은 거액의 의무는 함부로 인정할 수 없다는 점 논증
대법원은 계약서와 같이 명확한 처분문서는 특별한 사정이 없는 한 문언 그대로 해석해야 하고, 그 해석이 상대방에게 무거운 책임을 지우는 경우일수록 더욱 엄격하게 판단해야 한다는 확립된 법리를 가지고 있습니다.
이 사건 계약서는 매수인이 부담할 부가가치세를 1,500만 원이라는 구체적 금액으로 명시하고 있었을 뿐, 세금이 늘어날 경우 그 차액까지 매수인이 부담한다는 조항은 존재하지 않았습니다.
매도인이 근거로 든 가액 변경 특약 역시 '거래신고 전까지'로 시한이 명확히 정해져 있었는데, 실제로는 그 기한 내에 아무런 협의도 이루어지지 않았습니다.
계약서 금액을 훌쩍 넘는 의무를 암묵적 합의로 인정하는 것은 대법원의 엄격해석 기준에 정면으로 반한다는 점을 집중적으로 변론하였습니다.
2. 매입세액공제를 받을 수 있다는 1심의 전제가 세법상 사실과 다르다는 점 입증
매입세액공제를 받으려면 세금계산서를 뒤늦게 받은 경우 부가가치세법 시행령이 정한 기한, 즉 확정신고기한 다음 날부터 1년 이내에 발급받아야 합니다. 이 사건에서 매도인이 실제로 수정세금계산서를 발급한 시점은 이 기한을 이미 지난 뒤였습니다.
저희는 이를 법리 주장에 그치지 않고 국세청 홈택스 조회 결과로 발급 시점을 객관적으로 확인하였으며, 의뢰인이 실제로 매입세액공제를 신청하였다가 바로 이 조항을 이유로 거부당한 통지서까지 증거로 제출하여, 세금을 돌려받을 수 있다는 1심 판단의 전제 자체가 성립할 수 없음을 입증하였습니다.
선고의 결과
항소심 재판부는 저희 법인의 주장을 받아들여 1심 판결 중 피고 패소 부분을 취소하고, 원고의 청구를 전부 기각하였습니다.
계약서에 부가가치세가 1,500만 원으로 명시되어 있었고 가액 변경도 거래신고 전까지로만 예정되어 있었던 점, 당사자들의 암묵적 의사는 매수인이 세금을 돌려받을 수 있다는 전제 위에 있었던 점, 그런데 실제로는 기한을 넘겨 발급된 수정세금계산서로 매입세액공제를 받을 수 없었고 의뢰인의 공제 신청도 기각되었던 점, 그럼에도 추가 부담을 인정하면 매수인이 공제도 받지 못한 채 세금만 떠안는 중대한 불이익을 입게 되는 점을 근거로 들었습니다.
소송비용도 매도인이 전부 부담하도록 하였습니다.
성공의 의의
이 사건은 1심에서 패소하였더라도 판결의 논리 구조를 정밀하게 분해하면 항소심에서 결과를 뒤집을 수 있음을 보여준 사례입니다.
부동산 매매계약에서 건물분 부가가치세를 둘러싼 분쟁은, 계약서에 명시되지 않은 위험을 누가 부담할지가 사후에 다투어지는 경우가 많습니다.
계약 해석에 관한 민사 법리와 매입세액공제 요건이라는 세법상 쟁점을 함께 검토함으로써, 계약서 문언을 넘어서는 의무를 암묵적 합의라는 이름으로 인정할 수 없다는 원칙을 관철할 수 있었습니다.
부동산 매매계약에서 건물 가액이나 세금 부담과 관련하여 예상치 못한 추가 청구를 받으신 경우, 계약서에 명시된 문언의 범위와 실제로 세금을 돌려받을 수 있는지 여부를 함께 따져보는 것이 중요합니다. 1심에서 불리한 판결을 받으셨더라도, 판결 이유를 항목별로 재검토하면 반전의 실마리를 찾을 수 있는 경우가 있습니다.






